第二次EHB拍賣于2024年12月啟動，至2025年2月20日結束，共吸引了來自11個國家的61個項目投標。其中，有8個投標來自氫氣生產商與海運領域承購商的聯合體。5月20日，歐盟委員會正式公布了在歐洲經濟區(EEA)內選定的15個可再生制氫項目，這些項目將從歐盟排放交易體系(ETS)的創新基金中獲得總計9.92億歐元的資金支持。
這些選定的項目分布在五個國家，預計將在未來十年內，在交通運輸、化學工業或甲醇和氨生產等領域生產近220萬噸可再生氫，同時避免超過1500萬噸的二氧化碳排放。歐盟委員會表示，這筆補貼將有助于縮小中標者的生產成本與市場價格之間的差距，從而加速清潔燃料的推廣和應用。
15個項目的補貼金額各異，從800萬歐元到2.46億歐元不等，補貼期限最長可達10年。值得一提的是，此次拍賣首次為氫氣生產商設立了專項預算，并特別關注為海運業承購商提供服務。在挪威，有三家企業獲得了總計9670萬歐元的資助，分別是挪威氫能公司開發的RjukanH2、Gen2Energy開發的Gen2-LH2，以及HammerfestH2(由Green H開發)。
此外，西班牙、立陶宛和奧地利通過“拍賣即服務”功能，為其國內符合拍賣資格但未能獲得創新基金資助的項目分配了高達8.36億歐元的國家資金。
選定的15個項目預計將在未來十年內生產近220萬噸可再生氫，從而避免超過1500萬噸的二氧化碳排放。這些項目將與歐洲氣候、基礎設施和環境執行局(CINEA)制定資助協議，并計劃于2025年9月/10月簽署。
根據《清潔工業協議》，第三次歐洲氫能銀行拍賣計劃于2025年底舉行，預算同樣高達10億歐元。歐盟委員會還計劃啟動歐洲氫能銀行下的氫能機制，旨在將買家和賣家聚集在一起，促進市場參與者之間的信息共享和商業合作。
